R语言多重比较示例:Bonferroni校正法和Benjamini & Hochberg法
假设检验的基本原理是小概率原理,即我们认为小概率事件在一次试验中实际上不可能发生。 多重比较的问题 当同一研究问题下进行多次假设检验时,不再符合小概率原理所说的“一次试验”。如果在该研究问题下只要有检验是阳性的,就对该问题下阳性结论的话,对该问题的检验的犯一类错误的概率就会增大。如果同一问题下进行n次检验,每次的检验水准为α(每次假阳性概率为α),则n次检验至少出现一次...

SGAT丨基于R语言tidyverse的vcf转txt文件算法,SNP位点判断与自动校正,染色体格式替换
算法:vcf转txt并自动规范化引言vcf文件是存放基因变异信息的一种方式,本文提供一种算法,用于读取vcf文件并转换等位基因展示方法、替换染色体展示格式、以及自动识别非唯一变异并进行修改,用于对变异信息进行整理。主要步骤与设计思路读取VCF文件并分为三部分储存提取变异信息并批量替换修改染色体格式SNP位点的判断与校正单点碱基差异唯一化项目运行环境centos7 linuxR4.2.3具体操作步....

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