TxGemma:谷歌DeepMind革命药物研发!270亿参数AI药理学家24小时在线
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魔搭中文开源模型社区:模型即服务-药物设计中的开源AI模型Uni-Fold及Uni-Mol(上)
作者:柯国霖,深势科技机器学习负责人 一、 蛋白质测序背景 在药物设计中,最关键的两个对象是蛋白质和小分子其,主要特征是小分子药物。比如口服药物进入体内之后,跟身体内某些蛋白的靶点结合,从而改变蛋白的某些功能,实现药物效果。综上所述,靶点药物最关键的是蛋白结构,所以蛋白质结构预测是非常关键的问题。 对于小分子来说,小分子药物是否有毒?好不好代....

魔搭中文开源模型社区:模型即服务-药物设计中的开源AI模型Uni-Fold及Uni-Mol(中)
二、 Uni-Fold概览 Uni-Fold为了打破AlphaFold的限制。目前已开源的Uni-Fold训练代码,经过MPI并行、数据异步读取、混合精度训练等优化工作,支持高效GPU训练。 基于优化后的训练代码,深势科技团队实现在128块NVIDIA GPU上进行AlphaFold2模型的全规模训练,并将持续优化所得模型。Uni-Fold的推理代码更加轻量、高效....

魔搭中文开源模型社区:模型即服务-药物设计中的开源AI模型Uni-Fold及Uni-Mol(下)
三、 Uni-Mol概览 近年来,预训练在药物设计中获得了巨大的关注。早期的MRL模型直接使用NLP模型,如BERT,从SMILES等一维序列中学习。最近的MRL模型使用图模型,从二维分子图中学习。 如果科研人员需要提高分子的特性和药物的效果,主要由三维结构决定。为了扩大应用范围,许多任务需要3D位置输出,如构象生成、结合姿势预测等。 近期的....

提速1200倍!MIT开发新一代药物研发AI,吊打老模型
【新智元导读】MIT研究人员开发了一个几何深度学习模型。该模型在成功将类药物分子与蛋白质结合方面,比最快的计算分子对接模型更快、更准确,减少了药物试验失败的机会和成本。众所周知,整个宇宙充满着无数分子。 这些分子中又有多少具有潜在的类似药物的特性,可用于开发挽救生命的药物呢?是百万级?还是十亿级?又或是万亿级? 答案是:10的60次幂。 如此巨大的数字,大大延缓了新....

Nat. Biotech.|药物设计的AI生成模型
今天介绍2020年1月30日发表在Nature Biotechnology上的评论,作者为Relay Therapeutics公司的Walters和Murcko,该论文评价了当前几种基于AI的药物生成模型存在的问题。同时,该期刊同期发表了Insilico Medicine的CEO Alex Zhavoronkov 和多伦多大学Alán Aspuru-Guzik对于该评论的回复。1研究背景药物发现....

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