三代测序组装方案_医疗健康

三代测序组装解决方案

三代测序组装解决方案为大基因组组装提供高效稳定的技术支持，三代测序与二代测序相比有着长读长的天然的技术优势，正得到市场的青睐，但是基因组组装速度慢，耗时长也阻碍了应用的推广。阿里云三代测序组装方案，在保证最终结果一致的条件下，无需改变传统软件用法，节约50%以上的效率和成本。

方案架构

架构介绍

1.不改变计算结果的条件下做算法优化

2.优化固定集群为按需计算服务，根据任务类型分配实例

3.组装软装CANU命令不变，提供性能监控和费用统计

方案价值

支持多个物种同时组装，不受资源规模限制，计算通量和项目完成时间有保障

计费模式灵活，完全按需计算，只需要支付实际使用计算资源

能够统计单个项目使用的资源和费用，成本清晰

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Canu软件同时适用于PacBio SMRT与纳米孔测序两款主流的单分子测序平台的数据，可以执行reads的纠错与组装部分的工作。阿里云优化三代组装软件Canu，在保证基因组的组装质量完全一样的情况，运行时间和成本降低50%以上。完美解决超大基因组组装耗时长，计算量大的难题。

方案优势

组装结果一致

不改变软件用法，最终结果保持一致，符合科研用户需要。

降本增效，节约50%以上的时间和成本

软件计算效率优化；
动态细粒度资源调度优化；
基因计算专属经济型实例。

支持多个组装项目同时执行，无需等待

弹性计算资源满足任意规模业务需要；
强大的存储产品保证并发计算带宽需求。

方便生产管理

内部多个用户/项目隔离，互不干扰；
提供计算性能监控，任务日志查询；
提供单个项目的费用统计。

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